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              S h e n g l i L a b S h e n g l i L a b H o m e T e a m P u b l i c a t i o n s R e s o u r c e s S h e n g l i L i r e c e i v e d h i s P h . D . i n M e d i c a l S y s t e m s B i o l o g y f r o m F u d a n U n i v e r s i t y i n 2 0 1 8 a n d P o s t d o c t o r a l t r a i n i n g f r o m t h e U n i v e r s i t y o f T e x a s H e a l t h S c i e n c e c e n t e r a t H o u s t o n d u r i n g 2 0 1 8 2 0 2 0 . H e i s a P r i n c i p a l I n v e s t i g a t o r w i t h t h e S h a n g h a i G e n e r a l H o s p i t a l a f f i l i a t e d t o S h a n g h a i J i a o T o n g U n i v e r s i t y . S h e n g l i i s a c o m p u t a t i o n a l b i o l o g i s t w i t h e x p e r t i s e i n h u m a n d i s e a s e g e n e t i c s , i n c l u d i n g c a n c e r a n d s k i n d i s e a s e s . H i s r e s e a r c h f o c u s e s o n i n t e g r a t i v e u t i l i z a t i o n o f c u t t i n g e d g e c o m p u t a t i o n a l b i o l o g y a l g o r i t h m s a n d m o l e c u l a r e x p e r i m e n t a l t e c h n o l o g i e s t o r e v e a l s y s t e m a t i c a l c h a n g e s a n d f u n c t i o n a l f a c t o r s i n h u m a n d i s e a s e p r o g r e s s i o n , d i s e a s e m i c r o e n v i r o n m e n t a n d r e s p o n s e t o d r u g t r e a t m e n t . R e s e a r c h I n t e r e s t s W e a r e d e d i c a t e d t o s o l v i n g c r i t i c a l q u e s t i o n s i n h u m a n d i s e a s e b i o l o g y b y u s i n g c u t t i n g e d g e b i o i n f o r m a t i c s a n d g e n o m i c s t e c h n o l o g i e s , e s p e c i a l l y c a n c e r . S p e c i a l l y , w e i n t e g r a t e c o m p u t a t i o n a l b i o l o g y a l g o r i t h m s a n d m o l e c u l a r e x p e r i m e n t a l t e c h n o l o g i e s t o r e v e a l s y s t e m a t i c a l c h a n g e s a n d f u n c t i o n a l f a c t o r s i n d i s e a s e p r o g r e s s i o n , d i s e a s e m i c r o e n v i r o n m e n t a n d r e s p o n s e t o d r u g t r e a t m e n t . O u r s t u d i e s a r e a i m i n g t o i m p e l t h e d e v e l o p m e n t o f i m m u n o t h e r a p y a n d t a r g e t e d t h e r a p y . F i r s t , w e u s e s i n g l e c e l l s e q u e n c i n g t e c h n o l o g y t o s t u d y d i s e a s e m i c r o e n v i r o n m e n t , e s p e c i a l l y t h e a c c u r a t e c o m p o s i t i o n s a n d f u n c t i o n s o f i n f i l t r a t e d i m m u n e c e l l s . S i n g l e c e l l s e q u e n c i n g i s a l s o u s e d t o s t u d y d i s e a s e h e t e r o g e n e i t y a n d i t s i m p a c t o n d i s e a s e c e l l f u n c t i o n s a n d d r u g s e n s i t i v i t y . S e c o n d , w e u t i l i z e b i o i n f o r m a t i c s m e t h o d s t o a n a l y z e d i s e a s e m u l t i o m i c s d a t a , r e v e a l i n g d i s e a s e s u b t y p e s , d r i v e r g e n e s a n d h e r e d i t a r y b a s i s o f o t h e r p a t h o g e n s , s u c h a s g e n e f u s i o n , a l t e r a t i o n s o f a l l e l e s a n d d i s e a s e s p e c i f i c i s o f o r m s . O u r s t u d y d i s c o v e r s c a n d i d a t e t a r g e t s f o r d i s e a s e d i a g n o s i s a n d t h e r a p y . T h i r d , w e d e v e l o p o r i g i n a l b i o i n f o r m a t i c s t o o l s f o r a n a l y s i s , i n t e g r a t i o n a n d v i s u a l i z a t i o n o f s i n g l e c e l l a n d o t h e r h i g h t h r o u g h p u t d i s e a s e o m i c s d a t a . W e e x p e c t t o p r o m o t e t h e d e v e l o p m e n t o f d i s e a s e i m m u n o t h e r a p y a n d t a r g e t e d t h e r a p y t h r o u g h i m m u n o g e n o m i c s . N e w s 2 0 2 3 0 2 0 2 : S h e n g l i s p a p e r i s a c c e p t e d i n N a t u r e C o m m u n i c a t i o n s ! 2 0 2 1 1 2 0 2 : T e n g s p a p e r i s a c c e p t e d i n C l i n i c a l a n d T r a n s l a t i o n a l D i s c o v e r y ! 2 0 2 1 1 1 0 4 : W e i s c o l l a b o r a t i v e p a p e r i s a c c e p t e d i n M o l e c u l a r T h e r a p y N u c l e i c A c i d s ! 2 0 2 1 1 0 1 6 : J i n g n i s R e v i e w p a p e r i s a c c e p t e d i n F r o n t i e r s i n I m m u n o l o g y ! 2 0 2 1 0 6 2 7 : W e i a n d Z h i x i a o s c o l l a b o r a t i v e p a p e r i s a c c e p t e d i n M o l e c u l a r T h e r a p y N u c l e i c A c i d s ! 2 0 2 1 0 6 0 7 : Z h i x i a o s S p o t l i g h t p a p e r i s a c c e p t e d i n T r e n d s i n G e n e t i c s ! 2 0 2 1 0 4 3 0 : Y a n g j u n s S p o t l i g h t p a p e r i s a c c e p t e d i n T r e n d s i n C a n c e r ! 2 0 2 1 0 4 2 1 : S h e n g l i w a s i n v i t e d t o b e t h e A s s o c i a t e E d i t o r o f F r o n t i e r s i n B i o i n f o r m a t i c s i n D r u g D i s c o v e r y i n B i o i n f o r m a t i c s s e c t i o n ! 2 0 2 1 0 3 2 9 : O u r c o l l a b o r a t i v e p a p e r i s a c c e p t e d i n M o l e c u l a r T h e r a p y N u c l e i c A c i d s ! 2 0 2 1 0 2 1 8 : S h e n g l i w a s i n v i t e d t o b e t h e G u e s t E d i t o r o f S p e c i a l I s s u e B i o i n f o r m a t i c s a n d M a c h i n e L e a r n i n g f o r C a n c e r B i o l o g y i n B i o l o g y ! 2 0 2 1 0 2 0 3 : Z h i x i a o s r e v i e w p a p e r i s p u b l i s h e d i n F r o n t i e r s i n I m m u n o l o g y ! 2 0 2 1 0 1 2 8 : W e i s p a p e r i s a c c e p t e d i n F r o n t i e r s i n C e l l a n d D e v e l o p m e n t a l B i o l o g y ! 2 0 2 1 0 1 2 7 : O u r c o l l a b o r a t i v e p a p e r i s a c c e p t e d i n S T A R P r o t o c o l s ! 2 0 2 0 1 0 0 8 : S h e n g l i L a b i s e s t a b l i s h e d i n S h a n g h a i G e n e r a l H o s p i t a l a f f i l i a t e d t o S h a n g h a i J i a o T o n g U n i v e r s i t y !

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