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A c c e s s t o w e b s e r v e r I D R B P P P C T I d e n t i f y i n g n u c l e i c a c i d b i n d i n g p r o t e i n s b a s e d o n P S S M a n d P S F M C r o s s T r a n s f o r m a t i o n A c c e s s t o w e b s e r v e r i D R B P E L i d e n t i f y i n g D N A b i n d i n g p r o t e i n s a n d R N A b i n d i n g p r o t e i n s b a s e d o n h i e r a r c h i c a l e n s e m b l e l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r s e l f A T f o l d p r o t e i n f o l d r e c o g n i t i o n b a s e d o n r e s i d u e b a s e d a n d m o t i f b a s e d s e l f a t t e n t i o n n e t w o r k s A c c e s s t o w e b s e r v e r T r a n s D F L i d e n t i f i c a t i o n o f d i s o r d e r e d f l e x i b l e l i n k e r r e g i o n s i n p r o t e i n s b y c o m b i n i n g s e q u e n c e l a b e l i n g a n d t r a n s f e r l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r P r e R B P T L p r e d i c t i o n o f s p e c i e s s p e c i f i c R N A b i n d i n g p r o t e i n s b a s e d o n t r a n s f e r l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r i C i r c D A L T R i d e n t i f i c a t i o n o f c i r c R N A d i s e a s e a s s o c i a t i o n s b a s e d o n l e a r n i n g t o r a n k A c c e s s t o w e b s e r v e r P r o t R e C N P r o t e i n r e m o t e h o m o l o g y d e t e c t i o n b y c o m b i n i n g c l a s s i f i c a t i o n m e t h o d s a n d n e t w o r k m e t h o d s v i a L e a r n i n g t o R a n k A c c e s s t o w e b s e r v e r D e e p I D P 2 L p r o t e i n i n t r i n s i c a l l y d i s o r d e r e d r e g i o n p r e d i c t i o n b y c o m b i n i n g c o n v o l u t i o n a l a t t e n t i o n n e t w o r k a n d h i e r a r c h i c a l a t t e n t i o n n e t w o r k . A c c e s s t o w e b s e r v e r P r e T P E L p r e d i c t i o n o f t h e r a p e u t i c p e p t i d e s b a s e d o n e n s e m b l e l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r P r e T P S t a c k T h e r a p e u t i c p e p t i d e s p r e d i c t i o n b a s e d o n a u t o w e i g h t e d m u l t i v i e w l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r i S n o D i L S G T i d e n t i f y i n g s n o R N A d i s e a s e a s s o c i a t i o n s b a s e d o n l o c a l s i m i l a r i t y c o n s t r a i n t a n d g l o b a l t o p o l o g i c a l c o n s t r a i n t A c c e s s t o w e b s e r v e r i D R N A I T F I d e n t i f y i n g D N A a n d R N A b i n d i n g r e s i d u e s i n p r o t e i n s b a s e d o n i n d u c t i o n a n d t r a n s f e r f r a m e w o r k A c c e s s t o w e b s e r v e r s A M P p r e d G A T P r e d i c t i o n o f A n t i m i c r o b i a l P e p t i d e s b a s e d o n G r a p h A t t e n t i o n N e t w o r k A c c e s s t o w e 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n c R N A L o c a t e E L A n o v e l m u l t i l a b e l S u b c e l l u l a r L o c a l i t y p r e d i c t i o n m o d e l o f n c R N A b a s e d o n e n s e m b l e l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r P r o F u n S O M P r o t e i n F u n c t i o n P r e d i c t i o n f o r S p e c i f i c O n t o l o g y b a s e d o n M u l t i p l e S e q u e n c e A l i g n m e n t R e c o n s t r u c t i o n A c c e s s t o w e b s e r v e r i P i D A S W G C N I d e n t i f i c a t i o n o f p i R N A d i s e a s e a s s o c i a t i o n s b a s e d o n S u p p l e m e n t a r i l y W e i g h t e d G r a p h C o n v o l u t i o n a l N e t w o r k A c c e s s t o w e b s e r v e r T P p r e d L E T h e r a p e u t i c p e p t i d e f u n c t i o n s p r e d i c t i o n b a s e d o n l a b e l e m b e d d i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r I D P _ L M P r e d i c t i o n o f p r o t e i n i n t r i n s i c d i s o r d e r a n d d i s o r d e r f u n c t i o n s b a s e d o n l a n g u a g e m o d e l s A c c e s s t o w e b s e r v e r i D R P r o S C I d e n t i f y i n g D N A B i n d i n g P r o t e i n s a n d R N A B i n d i n g P r o t e i n s b a s e d o n S u b f u n c t i o n C l a s s i f i e r s A c c e s s t o w e b s e r v e r D A m i R L o c G N e t m i R N A s u b c e l l u l a r l o c a l i z a t i o n p r e d i c t i o n b y c o m b i n i n g m i R N A d i s e a s e a s s o c i a t i o n s a n d g r a p h c o n v o l u t i o n a l n e t w o r k s A c c e s s t o w e b s e r v e r P D B B R E A l i g a n d p r o t e i n i n t e r a c t i o n b i n d i n g r e s i d u e e x t r a c t o r b a s e d o n P r o t e i n D a t a B a n k A c c e s s t o w e b s e r v e r I D P F u s i o n P r o t e i n i n t r i n s i c a l l y d i s o r d e r e d r e g i o n p r e d i c t i o n b y c o m b i n i n g N e u r a l A r c h i t e c t u r e S e a r c h a n d M u l t i o b j e c t i v e g e n e t i c a l g o r i t h m A c c e s s t o w e b s e r v e r M 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A S u b c e l l u l a r L o c a l i z a t i o n u s i n g R N A S t r u c t u r e L a n g u a g e M o d e l A c c e s s t o w e b s e r v e r i M F P L G i M F P L G : I d e n t i f i c a t i o n o f N o v e l M u l t i F u n c t i o n a l P e p t i d e s b y U s i n g P r o t e i n L a n g u a g e M o d e l s a n d G r a p h B a s e d D e e p L e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r i N u c R e s A S S H i N u c R e s A S S H : I d e n t i f y i n g n u c l e i c a c i d ‐ b i n d i n g r e s i d u e s i n p r o t e i n s b y u s i n g s e l f ‐ a t t e n t i o n ‐ b a s e d s t r u c t u r e ‐ s e q u e n c e h y b r i d n e u r a l n e t w o r k A c c e s s t o w e b s e r v e r S 2 L P S I B L A S T S 2 L P S I B L A S T : a s u p e r v i s e d t w o l a y e r s e a r c h f r a m e w o r k b a s e d o n P S I B L A S T f o r p r o t e i n r e m o t e h o m o l o g y d e t e c t i o n A c c e s s t o w e b s e r v e r T P p r e d A T M V T P p r e d A T M V : t h e r a p e u t i c p e p t i d e p r e d i c t i o n b y a d a p t i v e m u l t i v i e w t e n s o r l e a r n i n g m o d e l A c c e s s t o w e b s e r v e r T P p r e d S C T P p r e d S C : m u l t i f u n c t i o n a l t h e r a p e u t i c p e p t i d e p r e d i c t i o n b a s e d o n m u l t i l a b e l s u p e r v i s e d c o n t r a s t i v e l e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r C F A G O C F A G O : c r o s s f u s i o n o f n e t w o r k a n d a t t r i b u t e s b a s e d o n a t t e n t i o n m e c h a n i s m f o r p r o t e i n f u n c t i o n p r e d i c t i o n A c c e s s t o w e b s e r v e r M C S A M u l t i c o n t e x t u a l s e l f a l i g n m e n t f r a m e w o r k f o r i n t e r p r e t a b l e c o n t i n u a l l e a r n i n g i n p r e d i c t i n g d r u g r e s p o n s e a n d e x p l o r i n g p h a r m a c o g e n o m i c b i o l o g y A c c e s s t o w e b s e r v e r T P p r e d C M v L P r e d i c t i o n o f M u l t i F u n c t i o n a l T h e r a p e u t i c P e p t i d e U s i n g C o n t r a s t M u l t i V i e w L e a r n i n g A c c e s s t o w e b s e r v e r i P i D A L G E i P i D A L G E : A L o c a l a n d G l o b a l G r a p h E n s e m b l e L e a r n i n g F r a m e w o r k f o r I d e n t i f y i n g P i R N A D i s e a s e A s s o c i a t i o n s A c c e s s t o w e b s e r v e r S T M S C A N o v e l M u l t i S l i c e F r a m e w o r k f o r P r e c i s i o n 3 D S p a t i a l D o m a i n R e c o n s t r u c t i o n a n d D i s e a s e P a t h o l o g y A n a l y s i s A c c e s s t o w e b s e r v e r K G I P A I n t e r p r e t a b l e P r a g m a t i c A n a l y s i s w i t h K n o w l e d g e G u i d e d f o r U n r a v e l i n g P e p t i d e P r o t e i n P a i r w i s e N o n C o v a l e n t M e c h a n i s m s A c c e s s t o w e b s e r v e r P r o G O P S L H y b r i d I n f o r m a t i o n d r i v e n P r o t e i n G e n e O n t o l o g y A n n o t a t i o n v i a t h e P r o t e i n S e q u 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D r . B i n L i u , e m a i l : b l i u @ b l i u l a b . n e t B i n L i u s l a b S c h o o l o f C o m p u t e r S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y , B e i j i n g I n s t i t u t e o f T e c h n o l o g y , C h i n a 网 站 备 案 号 : 粤 I C P 备 1 9 0 4 1 8 5 9 号 1 网 站 备 案 号 : 粤 I C P 备 1 9 0 4 1 8 5 9 号 1

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